Hello,
Il y a déjà plusieurs utilitaires qui peuvent remplacer MSConfig (jen'ai plus les noms en tête, mais google is your friend !)
Et comme vous l'avez déjà dit, rien ne vous empêche d'utiliser les règles pour "simuler" un msconfig.
Par exemple, vous enlever tous les programmes qui sont dans le menu "démarrer/programmes/démarrage", et vous les mettez en règle sur ProcessManager par exemple.
Cette règle se chargera de les lancer, avec quelques secondes d'intervalle.
C'est ce que j'utilise au taf, vu que j'ai minimum 4 appli ouvertes en permanence dès le boot, et qu'elles sont assez lourdes à charger.
Pour ce qui est des prog que vous ne voulez plus voir au lancement, là, il faut aller jouer directement dans la base de registre, ça sera plus rapide, et surtout "permament" !